С 1960 по 1971 гг. директором Института являлся профессор Николай Аркадьевич Бобровский, который выполнял также обязанности Главного оториноларинголога Министерства здравоохранения РСФСР и МПС.
С 1966 г. при Институте был открыт специализированный Совет ВАК СССР по защитам докторских и кандидатских диссертаций, который постоянно работал. В 1972 году Институт возглавлял академик АМН СССР профессор Игорь Борисович Солдатов, который сочетал этот пост с заведованием кафедрой ЛОР болезней Куйбышевского медицинского института.
С 1972 по 1999 гг. Институтом руководил профессор Дмитрий Иванович Тарасов, который выполнял обязанности председателя Правления Всероссийского научного медицинского общества оториноларингологов, являлся главным оториноларингологом Министерства здравоохранения РСФСР и председателем проблемной комиссии по оториноларингологии, организовал IV и V всероссийские съезды оториноларингологов и ряд региональных конференций. Под его руководством выполнены и защищены 19 докторских и 36 кандидатских диссертаций.
Приказом Министерства здравоохранения СССР в 1977 году на Институт были возложены функции Всесоюзного
